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Experiment Overview

Repository ID: FR-FCM-Z2NZ Experiment name: CD38+ pDCs participate in coordinated immune responses to H1N1 challenge MIFlowCyt score: 26.25%
Primary researcher: Zainab Rahil PI/manager: Zainab Rahil Uploaded by: Zainab Rahil
Experiment dates: 2020-01-15 - 2020-06-12 Dataset uploaded: Jun 2020 Last updated: Jun 2020
Keywords: [Bioinformatics] [immunology] Manuscripts:
Organizations: Stanford University, Stanford, CA (USA)
Purpose: FCS files and R scripts associated with manuscript: CD38+ pDCs participate in coordinated immune responses to H1N1 challenge
Conclusion: None
Comments: FCS files are labeled as: ID_day for 35 individuals (101-112,201-211,201-312) across 11 day time-points (-1,1,2,3,4,5,6,7,8,29,60). Virus challenge occurred on day 1 immediately following sample collection.
Funding: Not disclosed
Quality control: None


Experiment variables

Timepoints
· _-1 101_-1.fcs · 102_-1.fcs · 103_-1.fcs · 104_-1.fcs · 105_-1.fcs · 106_-1.fcs · 107_-1.fcs · 108_-1.fcs · 109_-1.fcs · 110_-1.fcs · 111_-1.fcs · 112_-1.fcs · 201_-1.fcs · 202_-1.fcs · 203_-1.fcs · 204_-1.fcs · 205_-1.fcs · 206_-1.fcs · 207_-1.fcs · 208_-1.fcs · 209_-1.fcs · 210_-1.fcs · 211_-1.fcs · 301_-1.fcs · 302_-1.fcs · 303_-1.fcs · 304_-1.fcs · 305_-1.fcs · 306_-1.fcs · 307_-1.fcs · 308_-1.fcs · 309_-1.fcs · 310_-1.fcs · 311_-1.fcs · 312_-1.fcs
· _1 101_1.fcs · 102_1.fcs · 103_1.fcs · 104_1.fcs · 105_1.fcs · 106_1.fcs · 107_1.fcs · 108_1.fcs · 109_1.fcs · 110_1.fcs · 111_1.fcs · 112_1.fcs · 201_1.fcs · 202_1.fcs · 203_1.fcs · 204_1.fcs · 205_1.fcs · 206_1.fcs · 207_1.fcs · 208_1.fcs · 209_1.fcs · 210_1.fcs · 211_1.fcs · 301_1.fcs · 302_1.fcs · 303_1.fcs · 304_1.fcs · 305_1.fcs · 306_1.fcs · 307_1.fcs · 308_1.fcs · 309_1.fcs · 310_1.fcs · 311_1.fcs · 312_1.fcs
· _2 101_2.fcs · 102_2.fcs · 103_2.fcs · 104_2.fcs · 105_2.fcs · 106_2.fcs · 107_2.fcs · 108_2.fcs · 109_2.fcs · 110_2.fcs · 111_2.fcs · 112_2.fcs · 201_2.fcs · 202_2.fcs · 203_2.fcs · 204_2.fcs · 205_2.fcs · 206_2.fcs · 207_2.fcs · 208_2.fcs · 209_2.fcs · 210_2.fcs · 211_2.fcs · 301_2.fcs · 302_2.fcs · 303_2.fcs · 304_2.fcs · 305_2.fcs · 306_2.fcs · 307_2.fcs · 308_2.fcs · 309_2.fcs · 310_2.fcs · 311_2.fcs · 312_2.fcs
· _3 101_3.fcs · 102_3.fcs · 103_3.fcs · 104_3.fcs · 105_3.fcs · 106_3.fcs · 107_3.fcs · 108_3.fcs · 109_3.fcs · 110_3.fcs · 111_3.fcs · 112_3.fcs · 201_3.fcs · 202_3.fcs · 203_3.fcs · 204_3.fcs · 205_3.fcs · 206_3.fcs · 207_3.fcs · 208_3.fcs · 209_3.fcs · 210_3.fcs · 211_3.fcs · 301_3.fcs · 302_3.fcs · 303_3.fcs · 304_3.fcs · 305_3.fcs · 306_3.fcs · 307_3.fcs · 308_3.fcs · 309_3.fcs · 310_3.fcs · 311_3.fcs · 312_3.fcs
· _4 101_4.fcs · 102_4.fcs · 103_4.fcs · 104_4.fcs · 105_4.fcs · 106_4.fcs · 107_4.fcs · 108_4.fcs · 109_4.fcs · 110_4.fcs · 111_4.fcs · 112_4.fcs · 201_4.fcs · 202_4.fcs · 203_4.fcs · 204_4.fcs · 205_4.fcs · 206_4.fcs · 207_4.fcs · 208_4.fcs · 209_4.fcs · 210_4.fcs · 211_4.fcs · 301_4.fcs · 302_4.fcs · 303_4.fcs · 304_4.fcs · 305_4.fcs · 306_4.fcs · 307_4.fcs · 308_4.fcs · 309_4.fcs · 310_4.fcs · 311_4.fcs · 312_4.fcs
· _5 101_5.fcs · 102_5.fcs · 103_5.fcs · 104_5.fcs · 105_5.fcs · 106_5.fcs · 107_5.fcs · 108_5.fcs · 109_5.fcs · 110_5.fcs · 111_5.fcs · 112_5.fcs · 201_5.fcs · 202_5.fcs · 203_5.fcs · 204_5.fcs · 205_5.fcs · 206_5.fcs · 207_5.fcs · 208_5.fcs · 209_5.fcs · 210_5.fcs · 211_5.fcs · 301_5.fcs · 302_5.fcs · 303_5.fcs · 304_5.fcs · 305_5.fcs · 306_5.fcs · 307_5.fcs · 308_5.fcs · 309_5.fcs · 310_5.fcs · 311_5.fcs · 312_5.fcs
· _6 101_6.fcs · 102_6.fcs · 103_6.fcs · 104_6.fcs · 105_6.fcs · 106_6.fcs · 107_6.fcs · 108_6.fcs · 109_6.fcs · 110_6.fcs · 111_6.fcs · 112_6.fcs · 201_6.fcs · 202_6.fcs · 203_6.fcs · 204_6.fcs · 205_6.fcs · 206_6.fcs · 207_6.fcs · 208_6.fcs · 209_6.fcs · 210_6.fcs · 211_6.fcs · 301_6.fcs · 302_6.fcs · 303_6.fcs · 304_6.fcs · 305_6.fcs · 306_6.fcs · 307_6.fcs · 308_6.fcs · 309_6.fcs · 310_6.fcs · 311_6.fcs · 312_6.fcs
· _7 101_7.fcs · 102_7.fcs · 103_7.fcs · 104_7.fcs · 105_7.fcs · 106_7.fcs · 107_7.fcs · 108_7.fcs · 109_7.fcs · 110_7.fcs · 111_7.fcs · 112_7.fcs · 201_7.fcs · 202_7.fcs · 203_7.fcs · 204_7.fcs · 205_7.fcs · 206_7.fcs · 207_7.fcs · 208_7.fcs · 209_7.fcs · 210_7.fcs · 211_7.fcs · 301_7.fcs · 302_7.fcs · 303_7.fcs · 304_7.fcs · 305_7.fcs · 306_7.fcs · 307_7.fcs · 308_7.fcs · 309_7.fcs · 310_7.fcs · 311_7.fcs · 312_7.fcs
· _8 101_8.fcs · 102_8.fcs · 103_8.fcs · 104_8.fcs · 105_8.fcs · 106_8.fcs · 107_8.fcs · 108_8.fcs · 109_8.fcs · 110_8.fcs · 111_8.fcs · 112_8.fcs · 201_8.fcs · 202_8.fcs · 203_8.fcs · 204_8.fcs · 206_8.fcs · 207_8.fcs · 208_8.fcs · 209_8.fcs · 210_8.fcs · 211_8.fcs · 301_8.fcs · 302_8.fcs · 303_8.fcs · 304_8.fcs · 305_8.fcs · 306_8.fcs · 307_8.fcs · 308_8.fcs · 309_8.fcs · 310_8.fcs · 311_8.fcs
· _29 101_29.fcs · 102_29.fcs · 103_29.fcs · 104_29.fcs · 105_29.fcs · 106_29.fcs · 107_29.fcs · 108_29.fcs · 109_29.fcs · 110_29.fcs · 111_29.fcs · 201_29.fcs · 202_29.fcs · 203_29.fcs · 204_29.fcs · 205_29.fcs · 206_29.fcs · 207_29.fcs · 208_29.fcs · 209_29.fcs · 210_29.fcs · 211_29.fcs · 301_29.fcs · 302_29.fcs · 303_29.fcs · 304_29.fcs · 305_29.fcs · 306_29.fcs · 307_29.fcs · 308_29.fcs · 309_29.fcs · 310_29.fcs · 311_29.fcs · 312_29.fcs
· _60 101_60.fcs · 102_60.fcs · 103_60.fcs · 104_60.fcs · 105_60.fcs · 106_60.fcs · 107_60.fcs · 108_60.fcs · 109_60.fcs · 110_60.fcs · 111_60.fcs · 201_60.fcs · 202_60.fcs · 203_60.fcs · 204_60.fcs · 205_60.fcs · 206_60.fcs · 207_60.fcs · 208_60.fcs · 209_60.fcs · 210_60.fcs · 211_60.fcs · 301_60.fcs · 302_60.fcs · 303_60.fcs · 306_60.fcs · 307_60.fcs · 308_60.fcs · 309_60.fcs · 310_60.fcs · 311_60.fcs · 312_60.fcs

Individuals
· 101 101_-1.fcs · 101_1.fcs · 101_2.fcs · 101_29.fcs · 101_3.fcs · 101_4.fcs · 101_5.fcs · 101_6.fcs · 101_60.fcs · 101_7.fcs · 101_8.fcs
· 102 102_-1.fcs · 102_1.fcs · 102_2.fcs · 102_29.fcs · 102_3.fcs · 102_4.fcs · 102_5.fcs · 102_6.fcs · 102_60.fcs · 102_7.fcs · 102_8.fcs
· 103 103_-1.fcs · 103_1.fcs · 103_2.fcs · 103_29.fcs · 103_3.fcs · 103_4.fcs · 103_5.fcs · 103_6.fcs · 103_60.fcs · 103_7.fcs · 103_8.fcs
· 104 104_-1.fcs · 104_1.fcs · 104_2.fcs · 104_29.fcs · 104_3.fcs · 104_4.fcs · 104_5.fcs · 104_6.fcs · 104_60.fcs · 104_7.fcs · 104_8.fcs
· 105 105_-1.fcs · 105_1.fcs · 105_2.fcs · 105_29.fcs · 105_3.fcs · 105_4.fcs · 105_5.fcs · 105_6.fcs · 105_60.fcs · 105_7.fcs · 105_8.fcs
· 106 106_-1.fcs · 106_1.fcs · 106_2.fcs · 106_29.fcs · 106_3.fcs · 106_4.fcs · 106_5.fcs · 106_6.fcs · 106_60.fcs · 106_7.fcs · 106_8.fcs
· 107 107_-1.fcs · 107_1.fcs · 107_2.fcs · 107_29.fcs · 107_3.fcs · 107_4.fcs · 107_5.fcs · 107_6.fcs · 107_60.fcs · 107_7.fcs · 107_8.fcs
· 108 108_-1.fcs · 108_1.fcs · 108_2.fcs · 108_29.fcs · 108_3.fcs · 108_4.fcs · 108_5.fcs · 108_6.fcs · 108_60.fcs · 108_7.fcs · 108_8.fcs
· 109 109_-1.fcs · 109_1.fcs · 109_2.fcs · 109_29.fcs · 109_3.fcs · 109_4.fcs · 109_5.fcs · 109_6.fcs · 109_60.fcs · 109_7.fcs · 109_8.fcs
· 110 110_-1.fcs · 110_1.fcs · 110_2.fcs · 110_29.fcs · 110_3.fcs · 110_4.fcs · 110_5.fcs · 110_6.fcs · 110_60.fcs · 110_7.fcs · 110_8.fcs
· 111 111_-1.fcs · 111_1.fcs · 111_2.fcs · 111_29.fcs · 111_3.fcs · 111_4.fcs · 111_5.fcs · 111_6.fcs · 111_60.fcs · 111_7.fcs · 111_8.fcs
· 112 112_-1.fcs · 112_1.fcs · 112_2.fcs · 112_3.fcs · 112_4.fcs · 112_5.fcs · 112_6.fcs · 112_7.fcs · 112_8.fcs
· 201 201_-1.fcs · 201_1.fcs · 201_2.fcs · 201_29.fcs · 201_3.fcs · 201_4.fcs · 201_5.fcs · 201_6.fcs · 201_60.fcs · 201_7.fcs · 201_8.fcs
· 202 202_-1.fcs · 202_1.fcs · 202_2.fcs · 202_29.fcs · 202_3.fcs · 202_4.fcs · 202_5.fcs · 202_6.fcs · 202_60.fcs · 202_7.fcs · 202_8.fcs
· 203 203_-1.fcs · 203_1.fcs · 203_2.fcs · 203_29.fcs · 203_3.fcs · 203_4.fcs · 203_5.fcs · 203_6.fcs · 203_60.fcs · 203_7.fcs · 203_8.fcs
· 204 204_-1.fcs · 204_1.fcs · 204_2.fcs · 204_29.fcs · 204_3.fcs · 204_4.fcs · 204_5.fcs · 204_6.fcs · 204_60.fcs · 204_7.fcs · 204_8.fcs
· 205 205_-1.fcs · 205_1.fcs · 205_2.fcs · 205_29.fcs · 205_3.fcs · 205_4.fcs · 205_5.fcs · 205_6.fcs · 205_60.fcs · 205_7.fcs
· 206 206_-1.fcs · 206_1.fcs · 206_2.fcs · 206_29.fcs · 206_3.fcs · 206_4.fcs · 206_5.fcs · 206_6.fcs · 206_60.fcs · 206_7.fcs · 206_8.fcs
· 207 207_-1.fcs · 207_1.fcs · 207_2.fcs · 207_29.fcs · 207_3.fcs · 207_4.fcs · 207_5.fcs · 207_6.fcs · 207_60.fcs · 207_7.fcs · 207_8.fcs
· 208 208_-1.fcs · 208_1.fcs · 208_2.fcs · 208_29.fcs · 208_3.fcs · 208_4.fcs · 208_5.fcs · 208_6.fcs · 208_60.fcs · 208_7.fcs · 208_8.fcs
· 209 209_-1.fcs · 209_1.fcs · 209_2.fcs · 209_29.fcs · 209_3.fcs · 209_4.fcs · 209_5.fcs · 209_6.fcs · 209_60.fcs · 209_7.fcs · 209_8.fcs
· 210 210_-1.fcs · 210_1.fcs · 210_2.fcs · 210_29.fcs · 210_3.fcs · 210_4.fcs · 210_5.fcs · 210_6.fcs · 210_60.fcs · 210_7.fcs · 210_8.fcs
· 211 211_-1.fcs · 211_1.fcs · 211_2.fcs · 211_29.fcs · 211_3.fcs · 211_4.fcs · 211_5.fcs · 211_6.fcs · 211_60.fcs · 211_7.fcs · 211_8.fcs
· 301 301_-1.fcs · 301_1.fcs · 301_2.fcs · 301_29.fcs · 301_3.fcs · 301_4.fcs · 301_5.fcs · 301_6.fcs · 301_60.fcs · 301_7.fcs · 301_8.fcs · 301_CONT.fcs
· 302 302_-1.fcs · 302_1.fcs · 302_2.fcs · 302_29.fcs · 302_3.fcs · 302_4.fcs · 302_5.fcs · 302_6.fcs · 302_60.fcs · 302_7.fcs · 302_8.fcs
· 303 303_-1.fcs · 303_1.fcs · 303_2.fcs · 303_29.fcs · 303_3.fcs · 303_4.fcs · 303_5.fcs · 303_6.fcs · 303_60.fcs · 303_7.fcs · 303_8.fcs
· 304 304_-1.fcs · 304_1.fcs · 304_2.fcs · 304_29.fcs · 304_3.fcs · 304_4.fcs · 304_5.fcs · 304_6.fcs · 304_7.fcs · 304_8.fcs
· 305 305_-1.fcs · 305_1.fcs · 305_2.fcs · 305_29.fcs · 305_3.fcs · 305_4.fcs · 305_5.fcs · 305_6.fcs · 305_7.fcs · 305_8.fcs
· 306 306_-1.fcs · 306_1.fcs · 306_2.fcs · 306_29.fcs · 306_3.fcs · 306_4.fcs · 306_5.fcs · 306_6.fcs · 306_60.fcs · 306_7.fcs · 306_8.fcs
· 307 307_-1.fcs · 307_1.fcs · 307_2.fcs · 307_29.fcs · 307_3.fcs · 307_4.fcs · 307_5.fcs · 307_6.fcs · 307_60.fcs · 307_7.fcs · 307_8.fcs
· 308 308_-1.fcs · 308_1.fcs · 308_2.fcs · 308_29.fcs · 308_3.fcs · 308_4.fcs · 308_5.fcs · 308_6.fcs · 308_60.fcs · 308_7.fcs · 308_8.fcs
· 309 309_-1.fcs · 309_1.fcs · 309_2.fcs · 309_29.fcs · 309_3.fcs · 309_4.fcs · 309_5.fcs · 309_6.fcs · 309_60.fcs · 309_7.fcs · 309_8.fcs
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