Experiment Overview
| Repository ID: | FR-FCM-Z5MQ | Experiment name: | Magnitude and kinetics of the human immune cell response associated with severe dengue progression by single-cell proteomics | MIFlowCyt score: | 24.14% |
| Primary researcher: | Makeda Robinson | PI/manager: | Shirit Einav | Uploaded by: | Makeda Robinson |
| Experiment dates: | 2019-01-01 - | Dataset uploaded: | Aug 2022 | Last updated: | Aug 2022 |
| Keywords: | [Dengue infection] [Severe dengue] [Pathogenesis; Immunology] [Single-cell proteomics] | Manuscripts: | |||
| Organizations: | None | ||||
| Purpose: | We performed immune profiling by mass cytometry of PBMCs collected longitudinally from severe dengue progressors and uncomplicated dengue patients to profile the magnitude of innate, adaptive and regulatory immune responses to DENV infection in humans. | ||||
| Conclusion: | None | ||||
| Comments: | None | ||||
| Funding: | Not disclosed | ||||
| Quality control: | None | ||||
Experiment variables
| Timepoints | |
|---|---|
| · First Blood Draw | 1_concat_1-002-1.fcs · 1_concat_1-003-1.fcs · 1_concat_1-005-1.fcs · 1_concat_1-017-1.fcs · 1_concat_1-021-1.fcs · 1_concat_1-023-1.fcs · 1_concat_1-032-1.fcs · 1_concat_1-038-1.fcs · 1_concat_1-040-1.fcs · 2_concat_1-001-1.fcs · 2_concat_1-014-1.fcs · 2_concat_1-019-1.fcs · 2_concat_1-030-1.fcs · 2_concat_1-039-1.fcs · 3_concat_5-010-1.fcs · 3_concat_5-012-1.fcs · 3_concat_5-017-1.fcs · 3_concat_5-018-1.fcs · 3_concat_5-019.fcs · 3_concat_5-023.fcs · 3_concat_5-030.fcs · 3_concat_5-036.fcs · 3_concat_5-047.fcs · 3_concat_5-090-1.fcs · 3_concat_5-193.fcs · 3_concat_5-195-1.fcs · 4_concat_1-008-1 .fcs · 4_concat_1-020-1.fcs · 4_concat_1-075.fcs · 4_concat_5-039-1.fcs · 4_concat_5-041.fcs · 4_concat_5-043-1.fcs · 4_concat_5-053-1.fcs · 4_concat_5-110-1.fcs · 4_concat_5-154.fcs · 4_concat_5-157-1.fcs · 4_concat_5-181.fcs · 4_concat_5-184.fcs · 4_concat_5-194.fcs · 4_concat_6-001.fcs · 4_concat_6-027-1.fcs · 4_concat_6-030-1.fcs · 5_concat_1-013.fcs · 5_concat_1-027.fcs · 5_concat_1-029.fcs · 5_concat_1-117.fcs · 5_concat_1-132.fcs · 5_concat_5-004.fcs · 5_concat_5-024.fcs · 5_concat_5-089.fcs · 5_concat_5-201.fcs · 5_concat_6-005.fcs · 5_concat_6-010.fcs · 5_concat_6-022.fcs · 5_concat_6-032.fcs · 6_concat_1-025.fcs · 6_concat_1-045.fcs · 6_concat_1-046.fcs · 6_concat_1-047.fcs · 6_concat_1-051.fcs · 6_concat_1-052.fcs · 6_concat_1-054.fcs · 6_concat_1-062.fcs · 6_concat_1-068.fcs · 6_concat_1-076.fcs · 6_concat_1-140.fcs · 6_concat_1-144.fcs · 6_concat_5-044.fcs · 6_concat_5-122.fcs · 7_concat_1-010.fcs · 7_concat_1-026.fcs · 7_concat_1-037.fcs · 7_concat_1-044.fcs · 7_concat_1-060.fcs · 7_concat_1-070.fcs · 7_concat_1-084.fcs · 7_concat_1-089.fcs · 7_concat_1-105.fcs · 7_concat_1-145.fcs · 7_concat_1-153.fcs · 7_concat_1-162.fcs · 7_concat_5-048.fcs · 7_concat_5-049.fcs · 7_concat_5-091.fcs · 8_concat_1-007.fcs · 8_concat_1-016.fcs · 8_concat_1-018.fcs · 8_concat_1-028.fcs · 8_concat_1-031.fcs · 8_concat_1-059.fcs · 8_concat_1-074.fcs · 8_concat_5-075.fcs · 8_concat_5-088.fcs |
| · Second Blood Draw | 1_concat_1-002-2.fcs · 1_concat_1-003-2.fcs · 1_concat_1-005-2.fcs · 1_concat_1-017-2.fcs · 1_concat_1-038-2.fcs · 1_concat_1-040-2.fcs · 2_concat_1-001-2.fcs · 2_concat_1-004-2.fcs · 2_concat_1-008-2.fcs · 2_concat_1-009-2.fcs · 2_concat_1-013-2.fcs · 2_concat_1-014-2.fcs · 2_concat_1-019-2.fcs · 2_concat_1-020-2.fcs · 2_concat_1-036-2.fcs · 8_concat_5-010-2.fcs · 8_concat_5-012-2.fcs · 8_concat_5-017-2.fcs · 8_concat_5-030-2.fcs · 8_concat_5-041-2.fcs · 8_concat_5-049-2.fcs |
| · Third Blood Draw | 1_concat_1-002-3.fcs · 1_concat_1-003-3.fcs · 2_concat_1-012-3.fcs · 2_concat_1-019-3.fcs · 2_concat_1-031-3.fcs · 8_concat_1-020-3.fcs · 8_concat_1-036-3.fcs |
| · Fourth Blood Draw | 7_concat_1-001-4.fcs · 7_concat_1-002-4.fcs · 8_concat_1-026-4.fcs |
| Sample Type | |
|---|---|
| · PBMCs | 1_concat_1-002-1.fcs · 1_concat_1-002-2.fcs · 1_concat_1-002-3.fcs · 1_concat_1-003-1.fcs · 1_concat_1-003-2.fcs · 1_concat_1-003-3.fcs · 1_concat_1-005-1.fcs · 1_concat_1-005-2.fcs · 1_concat_1-017-1.fcs · 1_concat_1-017-2.fcs · 1_concat_1-021-1.fcs · 1_concat_1-023-1.fcs · 1_concat_1-032-1.fcs · 1_concat_1-038-1.fcs · 1_concat_1-038-2.fcs · 1_concat_1-040-1.fcs · 1_concat_1-040-2.fcs · 1_concat_3-006.fcs · 1_concat_3-009.fcs · 1_concat_C-PA1.fcs · 2_concat_1-001-1.fcs · 2_concat_1-001-2.fcs · 2_concat_1-004-2.fcs · 2_concat_1-008-2.fcs · 2_concat_1-009-2.fcs · 2_concat_1-012-3.fcs · 2_concat_1-013-2.fcs · 2_concat_1-014-1.fcs · 2_concat_1-014-2.fcs · 2_concat_1-019-1.fcs · 2_concat_1-019-2.fcs · 2_concat_1-019-3.fcs · 2_concat_1-020-2.fcs · 2_concat_1-030-1.fcs · 2_concat_1-031-3.fcs · 2_concat_1-036-2.fcs · 2_concat_1-039-1.fcs · 2_concat_3-012.fcs · 2_concat_3-027.fcs · 2_concat_C-PA1.fcs · 3_concat_3-047-01.fcs · 3_concat_3-074-01.fcs · 3_concat_5-010-1.fcs · 3_concat_5-012-1.fcs · 3_concat_5-017-1.fcs · 3_concat_5-018-1.fcs · 3_concat_5-019.fcs · 3_concat_5-023.fcs · 3_concat_5-030.fcs · 3_concat_5-036.fcs · 3_concat_5-047.fcs · 3_concat_5-090-1.fcs · 3_concat_5-193.fcs · 3_concat_5-195-1.fcs · 3_concat_C-PA1.fcs · 4_concat_1-008-1 .fcs · 4_concat_1-020-1.fcs · 4_concat_1-075.fcs · 4_concat_3-015.fcs · 4_concat_3-017.fcs · 4_concat_5-039-1.fcs · 4_concat_5-041.fcs · 4_concat_5-043-1.fcs · 4_concat_5-053-1.fcs · 4_concat_5-110-1.fcs · 4_concat_5-154.fcs · 4_concat_5-157-1.fcs · 4_concat_5-181.fcs · 4_concat_5-184.fcs · 4_concat_5-194.fcs · 4_concat_6-001.fcs · 4_concat_6-027-1.fcs · 4_concat_6-030-1.fcs · 4_concat_C-PA1.fcs · 5_concat_1-013.fcs · 5_concat_1-027.fcs · 5_concat_1-029.fcs · 5_concat_1-117.fcs · 5_concat_1-132.fcs · 5_concat_3-005.fcs · 5_concat_3-014.fcs · 5_concat_3-018.fcs · 5_concat_3-051.fcs · 5_concat_5-004.fcs · 5_concat_5-024.fcs · 5_concat_5-089.fcs · 5_concat_5-201.fcs · 5_concat_6-005.fcs · 5_concat_6-010.fcs · 5_concat_6-022.fcs · 5_concat_6-032.fcs · 5_concat_C-PA1.fcs · 6_concat_1-025.fcs · 6_concat_1-045.fcs · 6_concat_1-046.fcs · 6_concat_1-047.fcs · 6_concat_1-051.fcs · 6_concat_1-052.fcs · 6_concat_1-054.fcs · 6_concat_1-062.fcs · 6_concat_1-068.fcs · 6_concat_1-076.fcs · 6_concat_1-140.fcs · 6_concat_1-144.fcs · 6_concat_3-033.fcs · 6_concat_3-053.fcs · 6_concat_5-044.fcs · 6_concat_5-122.fcs · 6_concat_C-PA1.fcs · 7_concat_1-001-4.fcs · 7_concat_1-002-4.fcs · 7_concat_1-010.fcs · 7_concat_1-026.fcs · 7_concat_1-037.fcs · 7_concat_1-044.fcs · 7_concat_1-060.fcs · 7_concat_1-070.fcs · 7_concat_1-084.fcs · 7_concat_1-089.fcs · 7_concat_1-105.fcs · 7_concat_1-145.fcs · 7_concat_1-153.fcs · 7_concat_1-162.fcs · 7_concat_3-038.fcs · 7_concat_3-043.fcs · 7_concat_5-048.fcs · 7_concat_5-049.fcs · 7_concat_5-091.fcs · 7_concat_C-PA1.fcs · 8_concat_1-007.fcs · 8_concat_1-016.fcs · 8_concat_1-018.fcs · 8_concat_1-020-3.fcs · 8_concat_1-026-4.fcs · 8_concat_1-028.fcs · 8_concat_1-031.fcs · 8_concat_1-036-3.fcs · 8_concat_1-059.fcs · 8_concat_1-074.fcs · 8_concat_5-010-2.fcs · 8_concat_5-012-2.fcs · 8_concat_5-017-2.fcs · 8_concat_5-030-2.fcs · 8_concat_5-041-2.fcs · 8_concat_5-049-2.fcs · 8_concat_5-075.fcs · 8_concat_5-088.fcs · 8_concat_C-PA1.fcs |
