Experiment Overview
| Repository ID: | FR-FCM-Z2ZU | Experiment name: | HSC-MSC interaction | MIFlowCyt score: | 94.66% |
| Primary researcher: | Aidan Gilchrist | PI/manager: | Brendan Harley | Uploaded by: | Aidan Gilchrist |
| Experiment dates: | 2017-02-01 - | Dataset uploaded: | Mar 2019 | Last updated: | Apr 2019 |
| Keywords: | [hematopoietic stem cells] [quiescence] [mesenchymal stromal cells (MSC)] [remodeling] [artificial stem cell niche] | Manuscripts: | |||
| Organizations: |
University of Illinois at Urbana-Champaign, Flow Cytometry Facility Roy J. Carver Biotechnology Center, Urbana, Illinois (United States)
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| Purpose: | To examine phenotypic changes in hematopoietic cells due to matrix properties and heterotypic interactions of hematopoietic stem cells and mesenchymal stromal cells. | ||||
| Conclusion: | Material properties and increasing concentrations of heterotypic signals cause differential hematopoietic lineage, with an increase in HSC maintenance occurring with moderate MSC signals in a low-diffusive environment. | ||||
| Comments: | None | ||||
| Funding: | National Institute of Diabetes and Digestive and Kidney Diseases of the National Institutes of Health under Award Numbers R01 DK099528 (B.A.C.H) and F31 DK117514 (A.E.G.), as well as by the National Institute of Biomedical Imaging and Bioengineering of the National Institutes of Health under Award Numbers R21 EB018481 (B.A.C.H.) and T32 EB019944 (A.E.G.). | ||||
| Quality control: | All conditions were performed with 3-6 replicates | ||||
Experiment variables
| Timepoints | |
|---|---|
| · Day 1 | Day 1 2017.03.16 A1.fcs · Day 1 2017.03.16 A2.fcs · Day 1 2017.03.16 A3.fcs · Day 1 2017.03.16 A4.fcs · Day 1 2017.03.16 A5.fcs · Day 1 2017.03.16 A6.fcs · Day 1 2017.03.16 C1.fcs · Day 1 2017.03.16 C2.fcs · Day 1 2017.03.16 C3.fcs · Day 1 2017.03.16 C4.fcs · Day 1 2017.03.16 C5.fcs · Day 1 2017.03.16 E1.fcs · Day 1 2017.03.16 E2.fcs · Day 1 2017.03.16 E3.fcs · Day 1 2017.03.16 E4.fcs · Day 1 2017.03.16 E5.fcs · Day 1 2017.03.16 E6.fcs · Day 1 2017.02.21 A1.1.fcs · Day 1 2017.02.21 A2.1.fcs · Day 1 2017.02.21 A3.1.fcs · Day 1 2017.02.21 C1.1.fcs · Day 1 2017.02.21 C2.1.fcs · Day 1 2017.02.21 C3.1.fcs · Day 1 2017.02.21 E1.1.fcs · Day 1 2017.02.21 E2.1.fcs · Day 1 2017.02.21 E3.1.fcs · Day 1 2017.03.16 E1.fcs-(1) · Day 1 2017.03.16 E2.fcs-(1) · Day 1 2017.03.16 E3.fcs-(1) · Day 1 2017.03.16 E4.fcs-(1) · Day 1 2017.03.16 E5.fcs-(1) · Day 1 2017.03.16 E6.fcs-(1) · Day 1 2017.03.03 A1.fcs · Day 1 2017.03.03 A2.fcs · Day 1 2017.03.03 A3.fcs · Day 1 2017.03.03 A4.fcs · Day 1 2017.03.03 A5.fcs · Day 1 2017.03.03 A6.fcs · Day 1 2017.03.03 C1.fcs · Day 1 2017.03.03 C2.fcs · Day 1 2017.03.03 C3.fcs · Day 1 2017.03.03 C4.fcs · Day 1 2017.03.03 C5.fcs · Day 1 2017.03.03 C6.fcs · Day 1 2017.03.03 E1.fcs · Day 1 2017.03.03 E2.fcs · Day 1 2017.03.03 E3.fcs · Day 1 2017.03.03 E4.fcs · Day 1 2017.03.03 E5.fcs |
| · Day 4 | Day 4 2017.03.19 A1.fcs · Day 4 2017.03.19 A2.fcs · Day 4 2017.03.19 A3.fcs · Day 4 2017.03.19 A4.fcs · Day 4 2017.03.19 A5.fcs · Day 4 2017.03.19 A6.fcs · Day 4 2017.03.19 C1.fcs · Day 4 2017.03.19 C2.fcs · Day 4 2017.03.19 C3.fcs · Day 4 2017.03.19 C4.fcs · Day 4 2017.03.19 C5.fcs · Day 4 2017.03.19 C6.fcs · Day 4 2017.03.19 E1.fcs · Day 4 2017.03.19 E2.fcs · Day 4 2017.03.19 E3.fcs · Day 4 2017.03.19 E4.fcs · Day 4 2017.03.19 E5.fcs · Day 4 2017.02.24 A1.4.fcs · Day 4 2017.02.24 A2.4.fcs · Day 4 2017.02.24 A3.4.fcs · Day 4 2017.02.24 A4.4.fcs · Day 4 2017.02.24 C1.4.fcs · Day 4 2017.02.24 C2.4.fcs · Day 4 2017.02.24 C3.4.fcs · Day 4 2017.02.24 C4.4.fcs · Day 4 2017.02.24 E1.4.fcs · Day 4 2017.02.24 E2.4.fcs · Day 4 2017.02.24 E3.4.fcs · Day 4 2017.02.24 E4.4.fcs · Day 4 2017.03.19 E1.fcs-(1) · Day 4 2017.03.19 E2.fcs-(1) · Day 4 2017.03.19 E3.fcs-(1) · Day 4 2017.03.19 E4.fcs-(1) · Day 4 2017.03.19 E5.fcs-(1) · Day 4 2017.03.19 E6.fcs · Day 4 2017.03.05 A1.fcs · Day 4 2017.03.05 A2.fcs · Day 4 2017.03.05 A3.fcs · Day 4 2017.03.05 A4.fcs · Day 4 2017.03.05 A5.fcs · Day 4 2017.03.05 A6.fcs · Day 4 2017.03.05 C1.fcs · Day 4 2017.03.05 C2.fcs · Day 4 2017.03.05 C3.fcs · Day 4 2017.03.05 C4.fcs · Day 4 2017.03.05 C5.fcs · Day 4 2017.03.05 C6.fcs · Day 4 2017.03.05 E1.fcs · Day 4 2017.03.05 E2.fcs · Day 4 2017.03.05 E3.fcs · Day 4 2017.03.05 E4.fcs · Day 4 2017.03.05 E5.fcs |
| · Day 7 | Day 7 2017.03.22 A1.fcs · Day 7 2017.03.22 A2.fcs · Day 7 2017.03.22 A3.fcs · Day 7 2017.03.22 A4.fcs · Day 7 2017.03.22 A5.fcs · Day 7 2017.03.22 A6.fcs · Day 7 2017.03.22 E1.fcs · Day 7 2017.03.22 E2.fcs · Day 7 2017.03.22 E3.fcs · Day 7 2017.03.22 E4.fcs · Day 7 2017.03.22 E5.fcs · Day 7 2017.02.27 A1.7.fcs · Day 7 2017.02.27 A2.7.fcs · Day 7 2017.02.27 A3.7.fcs · Day 7 2017.02.27 A4.7.fcs · Day 7 2017.02.27 C1.7.fcs · Day 7 2017.02.27 C2.7.fcs · Day 7 2017.02.27 C3.7.fcs · Day 7 2017.02.27 C4.7.fcs · Day 7 2017.02.27 E1.7.fcs · Day 7 2017.02.27 E2.7.fcs · Day 7 2017.02.27 E3.7.fcs · Day 7 2017.02.27 E4.7.fcs · Day 7 2017.03.22 E1.fcs-(1) · Day 7 2017.03.22 E2.fcs-(1) · Day 7 2017.03.22 E3.fcs-(1) · Day 7 2017.03.22 E4.fcs-(1) · Day 7 2017.03.22 E5.fcs-(1) · Day 7 2017.03.22 E6.fcs · Day 7 2017.03.08 A1.fcs · Day 7 2017.03.08 A2.fcs · Day 7 2017.03.08 A3.fcs · Day 7 2017.03.08 A4.fcs · Day 7 2017.03.08 A5.fcs · Day 7 2017.03.08 A6.fcs · Day 7 2017.03.08 C1.fcs · Day 7 2017.03.08 C2.fcs · Day 7 2017.03.08 C3.fcs · Day 7 2017.03.08 C4.fcs · Day 7 2017.03.08 C5.fcs · Day 7 2017.03.08 C6.fcs · Day 7 2017.03.08 E1.fcs · Day 7 2017.03.08 E2.fcs · Day 7 2017.03.08 E3.fcs · Day 7 2017.03.08 E4.fcs · Day 7 2017.03.08 E5.fcs · Day 7 2017.03.08 E6.fcs |
| Conditions | |
|---|---|
| · Low | Day 1 2017.03.16 A1.fcs · Day 1 2017.03.16 A2.fcs · Day 1 2017.03.16 A3.fcs · Day 1 2017.03.16 A4.fcs · Day 1 2017.03.16 A5.fcs · Day 1 2017.03.16 A6.fcs · Day 4 2017.03.19 A1.fcs · Day 4 2017.03.19 A2.fcs · Day 4 2017.03.19 A3.fcs · Day 4 2017.03.19 A4.fcs · Day 4 2017.03.19 A5.fcs · Day 4 2017.03.19 A6.fcs · Day 7 2017.03.22 A1.fcs · Day 7 2017.03.22 A2.fcs · Day 7 2017.03.22 A3.fcs · Day 7 2017.03.22 A4.fcs · Day 7 2017.03.22 A5.fcs · Day 7 2017.03.22 A6.fcs · Day 1 2017.02.21 A1.1.fcs · Day 1 2017.02.21 A2.1.fcs · Day 1 2017.02.21 A3.1.fcs · Day 4 2017.02.24 A1.4.fcs · Day 4 2017.02.24 A2.4.fcs · Day 4 2017.02.24 A3.4.fcs · Day 4 2017.02.24 A4.4.fcs · Day 7 2017.02.27 A1.7.fcs · Day 7 2017.02.27 A2.7.fcs · Day 7 2017.02.27 A3.7.fcs · Day 7 2017.02.27 A4.7.fcs · Day 1 2017.03.03 A1.fcs · Day 1 2017.03.03 A2.fcs · Day 1 2017.03.03 A3.fcs · Day 1 2017.03.03 A4.fcs · Day 1 2017.03.03 A5.fcs · Day 1 2017.03.03 A6.fcs · Day 4 2017.03.05 A1.fcs · Day 4 2017.03.05 A2.fcs · Day 4 2017.03.05 A3.fcs · Day 4 2017.03.05 A4.fcs · Day 4 2017.03.05 A5.fcs · Day 4 2017.03.05 A6.fcs · Day 7 2017.03.08 A1.fcs · Day 7 2017.03.08 A2.fcs · Day 7 2017.03.08 A3.fcs · Day 7 2017.03.08 A4.fcs · Day 7 2017.03.08 A5.fcs · Day 7 2017.03.08 A6.fcs |
| · Med | Day 1 2017.03.16 C1.fcs · Day 1 2017.03.16 C2.fcs · Day 1 2017.03.16 C3.fcs · Day 1 2017.03.16 C4.fcs · Day 1 2017.03.16 C5.fcs · Day 4 2017.03.19 C1.fcs · Day 4 2017.03.19 C2.fcs · Day 4 2017.03.19 C3.fcs · Day 4 2017.03.19 C4.fcs · Day 4 2017.03.19 C5.fcs · Day 4 2017.03.19 C6.fcs · Day 1 2017.02.21 C1.1.fcs · Day 1 2017.02.21 C2.1.fcs · Day 1 2017.02.21 C3.1.fcs · Day 4 2017.02.24 C1.4.fcs · Day 4 2017.02.24 C2.4.fcs · Day 4 2017.02.24 C3.4.fcs · Day 4 2017.02.24 C4.4.fcs · Day 7 2017.02.27 C1.7.fcs · Day 7 2017.02.27 C2.7.fcs · Day 7 2017.02.27 C3.7.fcs · Day 7 2017.02.27 C4.7.fcs · Day 1 2017.03.03 C1.fcs · Day 1 2017.03.03 C2.fcs · Day 1 2017.03.03 C3.fcs · Day 1 2017.03.03 C4.fcs · Day 1 2017.03.03 C5.fcs · Day 1 2017.03.03 C6.fcs · Day 4 2017.03.05 C1.fcs · Day 4 2017.03.05 C2.fcs · Day 4 2017.03.05 C3.fcs · Day 4 2017.03.05 C4.fcs · Day 4 2017.03.05 C5.fcs · Day 4 2017.03.05 C6.fcs · Day 7 2017.03.08 C1.fcs · Day 7 2017.03.08 C2.fcs · Day 7 2017.03.08 C3.fcs · Day 7 2017.03.08 C4.fcs · Day 7 2017.03.08 C5.fcs · Day 7 2017.03.08 C6.fcs · March 2 2017_MSC autofluorescent_019.fcs · March 2 2017_MSC stained_018.fcs |
| · High | Day 1 2017.03.16 E1.fcs · Day 1 2017.03.16 E2.fcs · Day 1 2017.03.16 E3.fcs · Day 1 2017.03.16 E4.fcs · Day 1 2017.03.16 E5.fcs · Day 1 2017.03.16 E6.fcs · Day 4 2017.03.19 E1.fcs · Day 4 2017.03.19 E2.fcs · Day 4 2017.03.19 E3.fcs · Day 4 2017.03.19 E4.fcs · Day 4 2017.03.19 E5.fcs · Day 7 2017.03.22 E1.fcs · Day 7 2017.03.22 E2.fcs · Day 7 2017.03.22 E3.fcs · Day 7 2017.03.22 E4.fcs · Day 7 2017.03.22 E5.fcs · Day 1 2017.02.21 E1.1.fcs · Day 1 2017.02.21 E2.1.fcs · Day 1 2017.02.21 E3.1.fcs · Day 1 2017.03.16 E1.fcs-(1) · Day 1 2017.03.16 E2.fcs-(1) · Day 1 2017.03.16 E3.fcs-(1) · Day 1 2017.03.16 E4.fcs-(1) · Day 1 2017.03.16 E5.fcs-(1) · Day 1 2017.03.16 E6.fcs-(1) · Day 4 2017.02.24 E1.4.fcs · Day 4 2017.02.24 E2.4.fcs · Day 4 2017.02.24 E3.4.fcs · Day 4 2017.02.24 E4.4.fcs · Day 4 2017.03.19 E1.fcs-(1) · Day 4 2017.03.19 E2.fcs-(1) · Day 4 2017.03.19 E3.fcs-(1) · Day 4 2017.03.19 E4.fcs-(1) · Day 4 2017.03.19 E5.fcs-(1) · Day 4 2017.03.19 E6.fcs · Day 7 2017.02.27 E1.7.fcs · Day 7 2017.02.27 E2.7.fcs · Day 7 2017.02.27 E3.7.fcs · Day 7 2017.02.27 E4.7.fcs · Day 7 2017.03.22 E1.fcs-(1) · Day 7 2017.03.22 E2.fcs-(1) · Day 7 2017.03.22 E3.fcs-(1) · Day 7 2017.03.22 E4.fcs-(1) · Day 7 2017.03.22 E5.fcs-(1) · Day 7 2017.03.22 E6.fcs · Day 1 2017.03.03 E1.fcs · Day 1 2017.03.03 E2.fcs · Day 1 2017.03.03 E3.fcs · Day 1 2017.03.03 E4.fcs · Day 1 2017.03.03 E5.fcs · Day 4 2017.03.05 E1.fcs · Day 4 2017.03.05 E2.fcs · Day 4 2017.03.05 E3.fcs · Day 4 2017.03.05 E4.fcs · Day 4 2017.03.05 E5.fcs · Day 7 2017.03.08 E1.fcs · Day 7 2017.03.08 E2.fcs · Day 7 2017.03.08 E3.fcs · Day 7 2017.03.08 E4.fcs · Day 7 2017.03.08 E5.fcs · Day 7 2017.03.08 E6.fcs |
| Doses | |
|---|---|
| · 1:0 | Day 1 2017.03.16 A1.fcs · Day 1 2017.03.16 A2.fcs · Day 1 2017.03.16 A3.fcs · Day 1 2017.03.16 A4.fcs · Day 1 2017.03.16 A5.fcs · Day 1 2017.03.16 A6.fcs · Day 4 2017.03.19 A1.fcs · Day 4 2017.03.19 A2.fcs · Day 4 2017.03.19 A3.fcs · Day 4 2017.03.19 A4.fcs · Day 4 2017.03.19 A5.fcs · Day 4 2017.03.19 A6.fcs · Day 7 2017.03.22 A1.fcs · Day 7 2017.03.22 A2.fcs · Day 7 2017.03.22 A3.fcs · Day 7 2017.03.22 A4.fcs · Day 7 2017.03.22 A5.fcs · Day 7 2017.03.22 A6.fcs · Day 1 2017.03.16 C1.fcs · Day 1 2017.03.16 C2.fcs · Day 1 2017.03.16 C3.fcs · Day 1 2017.03.16 C4.fcs · Day 1 2017.03.16 C5.fcs · Day 4 2017.03.19 C1.fcs · Day 4 2017.03.19 C2.fcs · Day 4 2017.03.19 C3.fcs · Day 4 2017.03.19 C4.fcs · Day 4 2017.03.19 C5.fcs · Day 4 2017.03.19 C6.fcs · Day 1 2017.03.16 E1.fcs · Day 1 2017.03.16 E2.fcs · Day 1 2017.03.16 E3.fcs · Day 1 2017.03.16 E4.fcs · Day 1 2017.03.16 E5.fcs · Day 1 2017.03.16 E6.fcs · Day 4 2017.03.19 E1.fcs · Day 4 2017.03.19 E2.fcs · Day 4 2017.03.19 E3.fcs · Day 4 2017.03.19 E4.fcs · Day 4 2017.03.19 E5.fcs · Day 7 2017.03.22 E1.fcs · Day 7 2017.03.22 E2.fcs · Day 7 2017.03.22 E3.fcs · Day 7 2017.03.22 E4.fcs · Day 7 2017.03.22 E5.fcs |
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