Experiment Overview
| Repository ID: | FR-FCM-Z3XB | Experiment name: | Novel S. cerevisiae hybrid synthetic promoters based on foreign core promoter sequences | MIFlowCyt score: | 41.00% |
| Primary researcher: | FENG Xiaofan | PI/manager: | Mario Andrea Marchisio | Uploaded by: | Feng Xiaofan |
| Experiment dates: | 2020-06-18 - 2021-03-12 | Dataset uploaded: | Apr 2021 | Last updated: | Apr 2021 |
| Keywords: | None | Manuscripts: | |||
| Organizations: |
Tianjin University, School of Pharmaceutical Science and Technology, Tianjin, (China)
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| Purpose: | In this work we constructed and optimized new synthetic constitutive promoters for the yeast Saccharomyces cerevisiae. We start from foreign (e.g. viral) core promoters as templates. They are, usually, unfunctional in yeast but can be activated by extending them with a short sequence, from the CYC1 promoter, containing various transcription start sites (TSSs). Overall, we extended the pool of S. cerevisiae promoters with 59 new samples, the strongest overcoming the native TEF2 promoter. | ||||
| Conclusion: | None | ||||
| Comments: | None | ||||
| Funding: | Not disclosed | ||||
| Quality control: | None | ||||
Experiment variables
| Individuals | |
|---|---|
| · Figure 2 | 103-1.fcs · 103-2.fcs · 103-3.fcs · 131-1.fcs · 131-2.fcs · 131-3.fcs · 134-1.fcs · 134-2.fcs · 134-3.fcs · 14-1.fcs · 14-2.fcs · 14-3.fcs · 143-1.fcs · 143-2.fcs · 143-3.fcs · 20-1.fcs · 20-2.fcs · 20-3.fcs · 205-1.fcs · 205-2.fcs · 205-3.fcs · 331-1.fcs · 38-1.fcs · 38-2.fcs · 38-3.fcs · 57-1.fcs · 57-2.fcs · 57-3.fcs · 783-1.fcs · 783-2.fcs · 783-3.fcs · 869-1.fcs · 869-2.fcs · 869-3.fcs · 871-1.fcs · 871-2.fcs · 871-3.fcs · 872-1.fcs · 872-2.fcs · 872-3.fcs · 873-1.fcs · 873-2.fcs · 873-3.fcs · 874-1.fcs · 874-2.fcs · 874-3.fcs · 876-1.fcs · 876-2.fcs · 876-3.fcs · 89-1.fcs · 89-2.fcs · 89-3.fcs · 920-1.fcs · 920-2.fcs · 920-3.fcs · 921-1.fcs · 921-2.fcs · 921-3.fcs · by331-2.fcs |
| · Figure 3 | 893-1.fcs · 893-2.fcs · 893-3.fcs · 901-1.fcs · 901-2.fcs · 901-3.fcs · 902-1.fcs · 902-2.fcs · 902-3.fcs · 903-1.fcs · 903-2.fcs · 903-3.fcs · 904-1.fcs · 904-2.fcs · 904-3.fcs · 905-1.fcs · 905-2.fcs · 905-3.fcs · 906-1.fcs · 906-2.fcs · 906-3.fcs · 907-1.fcs · 907-2.fcs · 907-3.fcs · 916-1.fcs · 916-2.fcs · 916-3.fcs · 918-1.fcs · 918-2.fcs · 918-3.fcs · 919-1.fcs · 919-2.fcs · 919-3.fcs · 940-1.fcs · 940-2.fcs · 940-3.fcs · 941-1.fcs · 941-2.fcs · 941-3.fcs · 942-1.fcs · 942-2.fcs · 942-3.fcs · 945-1.fcs · 945-2.fcs · 945-3.fcs · 970-1.fcs · 970-2.fcs · 970-3.fcs · 971-1.fcs · 971-2.fcs · 971-3.fcs · 972-1.fcs · 972-2.fcs · 972-3.fcs · 973-1.fcs · 973-2.fcs · 973-3.fcs · 974-1.fcs · 974-2.fcs · 974-3.fcs · 975-1.fcs · 975-2.fcs · 975-3.fcs · 976-1.fcs · 976-2.fcs · 976-3.fcs · 977-1.fcs · 977-2.fcs · 977-3.fcs · 978-1.fcs · 978-2.fcs · 978-3.fcs · 979-1.fcs · 979-2.fcs · 979-3.fcs · 980-1.fcs · 980-2.fcs · 980-3.fcs |
| · Figure 4 | 1142-1.fcs · 1142-2.fcs · 1142-3.fcs · 1143-1.fcs · 1143-2.fcs · 1143-3.fcs · 1144-1.fcs · 1144-2.fcs · 1144-3.fcs · 947-1.fcs · 947-2.fcs · 947-3.fcs · 948-1.fcs · 948-2.fcs · 948-3.fcs · 949-1.fcs · 949-2.fcs · 949-3.fcs · 981-1.fcs · 981-2.fcs · 981-3.fcs · 982-1.fcs · 982-2.fcs · 982-3.fcs · 983-1.fcs · 983-2.fcs · 983-3.fcs |
| · Figure 5 | 1170-1.fcs · 1170-2.fcs · 1170-3.fcs · 1171-1.fcs · 1171-2.fcs · 1171-3.fcs · 1172-1.fcs · 1172-2.fcs · 1172-3.fcs · 1203-1.fcs · 1203-2.fcs · 1203-3.fcs · 1204-1.fcs · 1204-2.fcs · 1204-3.fcs · 1205-1.fcs · 1205-2.fcs · 1205-3.fcs · 1206-1.fcs · 1206-2.fcs · 1206-3.fcs · 1231-1.fcs · 1231-2.fcs · 1231-3.fcs |
| · Figure6 | 1230-1.fcs · 1230-2.fcs · 1230-3.fcs · 1254-1.fcs · 1254-2.fcs · 1254-3.fcs · 1255-1.fcs · 1255-2.fcs · 1255-3.fcs · 1256-1.fcs · 1256-2.fcs · 1256-3.fcs |
| · Supplementary figures | 1232-1.fcs · 1232-2.fcs · 1232-3.fcs · 868-1.fcs · 868-2.fcs · 868-3.fcs · 877-1.fcs · 877-2.fcs · 877-3.fcs · 894-1.fcs · 894-2.fcs · 894-3.fcs · 900-1.fcs · 900-2.fcs · 900-3.fcs |
